Art des Experiments: Differentielle Genexpression
Studienziel: Differentielle Genexpressionsanalyse
Hybridisierungsanzahl: 10
Referenz für die Hybridisierung:
Array-Design: metg001 CancerArray (Affymetrix Technologie) ca. 3000 Gene welche
durch 6117 Probesets repräsentiert sind.
Software: Custom Software
Kriterien für die von Kanditatengenen: Fold change >3
Ergebnisse: Wir untersuchten mittels Genexpressionsanalyse 5 etablierte Pankreaskarzinomzellinien
(AsPC-1, BxPC-3, Capan-1, Capan-2, HPAF2), 4 primäre Karzinomzellinien
und eine primäre benigne Pankreaszellinie. Von 1540 Genen, die in wenigstens
drei Zellinien präsent waren, waren 122 in Tumorzellinien hoch- und 18
herunterreguliert. Nur für wenige der in den Tumorzellinien hochregulierten
Gene ist eine Rolle im Pankreaskarzinom beschrieben. Wir validierten das hochregulierte
Gen Thymosin 10 beta mittels Immunhistochemie und konnten die Überexpression
im humanen Pankreaskarzinom bestätigen.